导演：金·曼纳斯
主演：大卫·杜楚尼 吉莲·安德森 米彻·佩勒吉 威廉·B·戴维斯 汤姆·布莱德伍德 迪恩·哈格鲁德 布鲁斯·哈伍德 约翰·芬
继续延续上一季的剧 情，原来穆德受了骗，及时发 觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个 普通FBI特别探员不该 进入的地方”搜集需 要的资料。本季发展越来越精彩，一些 没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖民阴谋。史考莉被绑架时子宫被移除，但今年却出现了她的 孩子——艾蜜莉。今年制作 小组甚至找了两位知名 科幻小说家 操笔，客串写出两集剧本。另外今年也 有一集喜剧。整出X档案为了配合电影的上映，加 入了一些角色及 内容，“辛 迪加”组织的阴谋越来越明显，穆德再一次接近事 实的真相。穆德前女友的出现也对穆德与 史考莉间的关系做出重大考验。该季结束于吸 烟人烧毁了所有X档案卷宗。精彩剧情/对白：“管的他们那么多事呢， 咱们自己好好过 自己的，把日子过红火了 ，才是正经事情。卤碴的事情，已经拖白掌柜帮着找了，倒是眼下有个事情，荷花婶子和翠花婶子 要帮着点了。我和寒哥打算 成亲，到时 候喜宴还得麻烦你们两个。 ”
“我们太白医馆已 经在顾家庄定了不少的 药膏了，如今又要去大公 主那里订药膏，如今皇上 是强制我们要买 的，那也没有什么办法，只能 ，我们少买一 点吧。这些 药膏，若是伤口的，就给用 ，若是伤口大的，还是用意郡主的 吧，否则病人 也是实在受苦，暂时只能这样了。”
“你信不信，本公主不仅仅敢打你们，本公主还敢直接割了你们的舌头！ 再一句下贱？今日割不成 ，明日我也会 想尽办法。本公主的手里不少暗卫，?就算是有朝一日，本公主不在白澜了， 没法亲自 来割，那么本公主会让自己的暗卫，想尽一切办法做到。”
“休吧，既然想要休了我， 我也没有什么好的， 休吧。当初老二的事情和乔木的事情 上面，我的确是做错了，没有好 好的对待老二和老二媳妇 ，另外就是乔 木出事了，我想 着自己儿子和孙儿的利益，便想要让他分 家，不想波及到他们，让他们好好 的平静的日子变得 没有了。”
“妈，你听 到没，爸爸现在一回来 就总说沈柠的事儿，三句不 离那个女人，每次提起她 ，脸上都是带着笑，反而对我这个亲生女儿却是爱答不理，我猜……哎，算了 算了，我还是不说了，我受点委屈没关系，重要的是爸爸妈 妈能一直幸福下去，哎 ……”
