导演：金·曼纳斯
主演：大卫·杜楚尼 吉莲·安德森 米彻·佩勒吉 威廉·B·戴维斯 汤姆·布莱德伍德 迪恩·哈格鲁德 布鲁斯·哈伍德 约翰·芬
继续延续上 一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误 后和史考莉串通好来骗政府高层， 以潜入一个“作为一个普通 FBI特别探员不该进 入的地方”搜集需要的资 料。本季发展越 来越精彩，一些没有被完全改造的混血外星人联合 起来抵抗殖民阴谋 。史考莉被绑架时子宫 被移除， 但今年却出现了她的孩子——艾蜜莉。今 年制作小组甚至找了两位知名科幻小说家操笔，客串写出两集剧本。另外今 年也有一集喜剧。整出X档案为了配合电影的上映， 加入了一些角色及内容，“辛迪加 ”组织的阴谋越来越明显，穆 德再一次接近事实的真相。穆德前女友的出现 也对穆德与史考莉间的 关系做出重大考验。该季 结束于吸烟人 烧毁了所有X档案卷宗。精彩剧情/对白：“只怕是难 了，如今顾府也是左右为难。意郡主的确是 很聪慧，为百姓做了不少的 事情，但也就是因为她为百姓做了 那么多的事 情，皇上才会忌惮。 当初意郡主进了大理 寺，那么多的百姓 请命，只怕是惹恼了皇上 了。这会儿皇上难保 不会有趁着这次机会除掉意郡主的意思。”
“这件事情，本公主已经查过 了，太子就是 这贪玩，不心落水的，相关的人，也只有 照顾太子的下人而已，本 公主已经处置他们 了。如今要办 的，就是太子的后事。还有，皇上的意思，近来他的身体 不适，需要立新太子，新太子定的 是十三皇子。 礼部，开始办新太子的典礼。”
“王贤少爷，我不会考虑你的。而且如今 阴府正在发展中，也并不打算考虑成亲的事情。我们阴府素来 是女子继承府邸的，我 日后自然是要操心府 邸的事情，可没有多余的精力管王家的事情。日后阴 府也会有 上门的男子为我传宗接代的
“依着这样的进度，不需要很长的时间 了，大半个月的时间便可以直接开采完，晶石矿山 开采完之后，便成为一座空山了 ，我的意思是，直接让 它倒塌了，随后旁边两座矿山，便可以依法炮制的开采，左右不浪费所 有的资源，不是吗？”
“之前我和他大 嫂去家里的时候，怎么对我们的，你们也都看 到了，就这样的人， 你还想怎么样，在那里费这个精力做什么，还不如想想什么培养老大才是，今年老 大因为运气不好，没有考 上，但是 来年肯定是要拼尽全力的 ，今年看看要不要换个更好的书院才是 正经事情，争取明年咱们也来 个榜首，不过 这个榜首可是更有含金量的。”
