导演：金·曼纳斯
主演：大卫·杜楚尼 吉莲·安德森 米彻·佩勒吉 威廉·B·戴维斯 汤姆·布莱德伍德 迪恩·哈格鲁德 布鲁斯·哈伍德 约翰·芬
继续延续 上一季的剧情，原来穆德 受了骗，及时 发觉错误后和史考莉 串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为 一个普通FBI特别探员不该进入的地 方”搜集需要的资料。本季发展越来 越精彩，一些没有 被完全改造的混 血外星人联合 起来抵抗殖民阴谋。史考莉被绑架时子 宫被移除，但今 年却出现了她的孩子 ——艾蜜莉。今年制作小组甚至找了两位知名科幻小说家操笔，客串写出两集剧本。另外今年也有一集喜剧。整出X档案为了配合电影的上映，加入 了一些角色及 内容，“辛迪 加”组织的阴谋越来越 明显，穆德 再一次接近事实的真相。穆德前女友的出现也对穆德与史考莉间的关系做出重大考 验。该季 结束于吸烟人烧毁了所有X档案卷宗。精彩剧情/对白：“当初我 娘立了女户，我们家的顾姓便已经定好了，我 们家的祖宗，由我娘开始。自然是我娘主持祭祀，如果我娘不能 主持祭祀，那建祠堂 的事情就算了吧，日后我 们顾姓的祠堂，我们家自然会安排好。也不 是就非要选你们 这里的顾姓~”
“因为脑子坏了呗，以为 板上了意郡主就可以将来学到玄乙门的医术了 ，也不想想，那位意郡 主不过是师父是玄乙门弟 子而已，而大公主乃是玄乙门药门掌门的弟子 ，正宗的玄乙门弟子。你指着 意郡主，怕是还不如指着 能得到这次的机会
“庄主，这也并不是什么大事，无非是太长的时间没有见过，这梁氏一家子呢，不知道 该怎么和您 相处，如今这些东西又是刚刚得 到的，自然是会惶恐的，生 怕和庄主您接触做错了什 么，就不好了，那 自然是不敢接触了。只要多花点时间 ，和您熟悉了，清楚了您是什么样子的人，也就会越来越大胆 和越来越熟悉起来，倒不是什么大事情。”
“是这样的，朝廷要征兵的事情，你们应该也知 道了，要么就是家里要去一个男冉军营里，要么就是要出五十两银子，咱们家，老二分出去了，他 不乐意管林家的事情，如今咱们家也实在是没有办法了，林家人不多， 如今就是老林 头在干活，主要是为了 家里的生计，他年纪也不了，做不了几年了，而且去军营里 ，这个年纪，不就是死路一条吗？”
“姐，你这么欺负一个 长辈，到时候大家只会戳咱爹妈的脊梁骨，你咋就这么糊涂呢？ 赶紧跟你婆 婆道歉，不就是借个房子给姐夫 弟弟结婚的事情吗？于情于理都是应该的，你干 嘛这么小气？咱做 人还是要大方一点，与人为善。”
