导演：金·曼纳斯
主演：大卫·杜楚尼 吉莲·安德森 米彻·佩勒吉 威廉·B·戴维斯 汤姆·布莱德伍德 迪恩·哈格鲁德 布鲁斯·哈伍德 约翰·芬
继续延续上一季的剧情 ，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来 骗政府高层，以潜入一 个“作为一个普通FBI特别探员不该进 入的地方 ”搜集需 要的资料 。本季发展 越来越精彩，一些 没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖 民阴谋。史考莉被绑架时子宫被移除，但今年却出现 了她的孩子——艾蜜莉 。今年制作小组甚至找了两位知名科幻小说家操笔，客串写出两集剧 本。另外今年也有一集喜剧。整出X档案 为了配合电影的上映，加入 了一些角色及内容，“ 辛迪加”组织的阴 谋越来越明显，穆德再一次接近事实的真相。穆德前女友的出现也对穆德 与史考莉间的关系做出重大考验。该季结束于吸烟人烧 毁了所有X档案 卷宗。精彩剧情/对白：“也没有什么，就是他们让 本公主给他们行礼，本公主不愿意，他们 就什么灵公主是贱人。本公主这一 听，让本公主行礼这样的 事情吧，是对大 炎的冒犯，本公主代表大炎过来白澜，这么被冒犯了，岂不是让大炎一 并被冒犯了，那 我们大炎皇帝肯定是要不开心了是，也肯定 会觉得本公 主办事不利，当然要好好教育教育了。结果好家伙，居然还灵公主是贱人，白澜 皇上，你这 灵公主是贱人，那先帝和您是什么 啊！”
“爹娘，这可怎么办啊？乔木这伤是就这样好了 ，而且听人家酒楼掌柜的给了他们不少的银子 呢，这会儿给每家每户当初借了银子都砍了猪肉，要不是银子不 少，谁家有这样的手笔啊，这可怎么办啊，如今都已经分家了，就算是真的，也 没有咱们家什么事情啊。”
“娘，你误会了，我们也没有想到，趁着我们出门了，会有人 来吃这个肉不是。这个肉昨儿掉了，掉在地上沾到不干净的东西了，我们两没舍得扔，就想着等今 日回来了再看看怎么处理， 那里知道就被人吃了呢，要是吃完，拉肚子 什么的，这可怎么办啊 。”
“我的文 章是完全可以的，但是 今年考试，你们 也看到了， 第二日下雨了，实在 没有办法，再怎么护着，这卷子上面也落了雨滴，算 是脏污了，就要看是不是 大家都落了雨，大家都落了，那我肯定能中的，就怕有不少人没有落， 就便宜他们了， 就算是文章不好，也一样可以有收 获的。”
“何况这些事情也是你们自己当初答应的，我们凑了 钱，你考上了进士，将来是要帮上我们一二的，现在你没有考 上，我们那会银子来也没有 什么错，何况这银子还帮你们家度过难关了，你倒是好了 ，直接和我们结了仇，我们 这银子可是出的很亏的了。”
