《鱼》故事讲述在女主角华织与 两同伴到 冲绳海边旅游，在别墅中，她们竟然发现一条有脚的鱼，虽然华织用桌子把它 砸死并扔掉，但腥臭却 还在，而且鱼的尸体 也不翼而飞，女主角被尸 臭感染，最终死去 ，世界也被鱼身上的“脚”所占领 ，成千上万的人都被 鱼身上的”脚“所控制，是一 个灾难性的故事。动画版的《鱼》和漫画 版原作基本保持了相同的故事主线，只 是对其中部分人物和叙事顺序进行了改动。女主角华织与其好 友亚纪，惠理香去冲绳海 边进行毕业旅行，意外发现一种散发恶臭的步行鱼。随着时间的推移， 步行鱼开始大量在冲绳附近海岸登陆 ，担心未婚夫阿忠的华织只身回到东京，发现那里也变成了 步行鱼的天下。在飞机上与华织相识的记者白河为了能获得更多有关步 行鱼的信息，而与华织一同前往寻找阿忠。在 经历了一系列与步行 鱼生物的激烈对抗后， 二人终于抵达了阿忠叔叔小柳教授的研究室 。白河拿到了小柳对于步行鱼的绝密研究，华织也在研究室内发现了被不明病毒感染的阿忠。华 织和白河从 小柳口中得知， 原来步行鱼是日本在二战时期研究的秘密武器，但运载其的舰 船被炸沉在冲 绳附近海域。这种秘密武器还带有一种 神秘病毒 ，感染的生物将 会在身体内部产生大量瓦斯，从 而推动步行机器的运动。已 经感染的阿忠失去了控制，刺死了小柳，华织 和白河追随其 来到了大街 上。此时绝大部分 的人都遭到了感染，变成了全身肿胀且不停喷出恶臭瓦斯的惨 状。华织的朋友 惠理香变成了步行感染者，亚纪葬身于步行鱼池中。阿忠受到 其他感染者围攻而死，白河也受到了感染，最后只 有华织一人得以逃脱，和其他未被感染者一起乘船离开日本。然而在影 片的最后，步行感染者 已经遍布了全世界。 面对着的充满瓦斯的世界，华织只能轻叹着“我已 经习惯了...”
精彩剧情/对白：“大姐，咱不走，就在家里，如今家里日子好过了，就算是 不好过， 我顾青青也会照顾好你的。以 前咱们都快饿死的时候 ，也不见宁伯候府认 亲啊，以 前大姐被那个渣男欺负的时候，也不见宁伯候府来做主啊，现在大姐有钱了， 就来认亲了，谁知 道打的什么主意， 我顾青青就不同意。”
“从你落水之后，你就变了 很多，虽然很开心，但是 心里也明 白一些，姐姐是 我的姐姐，但是也许 这样的你，付出了很大 的代价。你做了那么多的事情，就是想要让我们在庄子里的 日子好过，你教我的这 些，即便是你不在庄子里了，我凭着自己的实力 ，也一样可以带着娘过 上好日子。”
“秦富余 ，做爷们就要爷们的样儿， 谁家爷们像你这样，猫 一阵狗一阵，反过来是理，正过来也是你的理，既然 大伙儿都在，就让大伙儿来给我家 评说评说 ，这犊子一开口 就管我家借五百，他也真好意思张这个嘴？ 真当我家开金山银山的啊 ，自家养孩子都费劲，去哪里给他弄 大几百？”
“以后不要再往我们这里塞一些不三不四的人了，我多少知道一些 ，你们塞人过来，也不单纯是为了什么帮助我们搞 生产，更多还是 有私心的，女儿家家 玩心眼我不管，但是不能 把心思放在生产上，这可 是关乎社员吃饱饭和交国家粮的大问 题，不是随随 便便能算计整鬼心思 的。”
“说到底，你们这些有钱的文化人还不照样被我这个乡下来的女人玩得团团转吗？有本事你让警察抓我啊， 哈哈哈，谁敢抓我，我就是欺负你女儿咋了？我恨 不得让她给我当牛做马，凭啥我的亲闺女吃不饱穿不暖，我还 得在家伺候你闺女，你们算老几啊？”
